Muzeum otwarte w 1994 roku, zaprojektowane przez japońskiego architekta Arata Isozaki przy współpracy Krzysztofa Ingardena i biura JET Atelier. Powstało z inicjatywy Andrzeja Wajdy, który przeznaczył na jego budowę środki z nagrody filmowej Kioto. W 2015 roku obok muzeum Manggha ukończono budowę Galerii Europa-Daleki Wschód zaprojektowanej przez Krzysztof Ingardena i Jacka Ewý. Projekt Mangghi został kilkukrotnie doceniony w konkursach architektonicznych, m.in. w 2006 trafił na listę 20 najciekawszych polskich realizacji po 1989 roku (Polska. Ikony architektury).