Powstał w wyniku rozbudowy realizowanego w trakcie I wojny światowej Miejskiego Zakładu Sanitarnego, którego projektantem był Jan Zawiejski (z tego okresu zachowała się m.in. modernistyczna kaplica). Od końca II wojny światowej – Miejski Szpital Miasta Krakowa, a później Miejski Szpital Zakaźny im. Dr Anki., od lat 90. ub. wieku funkcjonuje jako Krakowski Szpital Specjalistyczny im. Jana Pawła II.